人们对自闭症的认识，是一个逐渐探索的过程，在其过程中，有许多错误的认知，也走过许多弯路。自闭症儿童的特异行为令人费解，那么，这种疾病产生的真正原因是什么呢？
一、心因性理论（早期错误的，陈旧的，已经被摒弃的观念）
在20世纪40年代至60年代中期，很多专家认为自闭症是父母养育方式不当造成的。
例如，母亲疏远孩子，父母*太忙无暇照顾孩子等，这使自闭症孩子的父母既要承受孩子患自闭症的痛苦，又要忍受舆论的指责和内心的负罪感。
后来的研究发现，父母的教养方式和孩子的自闭症之间没有必然的联系，父母不必为孩子患自闭症而自责。
截止到目前*，大家形成的共识是，自闭症的病因主要是脑生物学原因，而造成脑生物学改变的原因主要有遗传学因素、免疫生化因素、围产期因素等。
二、遗传因素
（目前主流的观点）
自闭症与遗传及基因有着密切的联系。对有自闭症患者的家族的研究发现，儿童自闭症的同胞患病率为2%~8%,是一般人群发病率的50~100倍。
这说明遗传因素是儿童自闭症发病的重要原因。从基因的水平看，多数研究认为，自闭症是由于多基因遗传和环境因素及其他非遗传因素共同作用的结果。
所谓多基因遗传是指该疾病受两对以上等位基因的控制，但候选基因的数目和定位仍不清楚，迄今*，没有取得公认的研究结果。
三、免疫生化因素
（目前存在研究和争议的观点）
有研究发现，免疫功能障碍可能与自闭症的发生存在关联。有学者提出了病毒感染学说，认为免疫功能缺乏的个体在胎儿期或新生儿期增加了病毒感染的机会，这些易感病毒引起胎儿或新生儿中枢神经系统的永久性损害，从而导致了自闭症。
也有研究发现自闭症的发生与神经系统中神经递质的代谢失常有关。当前学界认为五羟色胺、多巴胺等神经递质与自闭症关系密切。
四、围产期因素
（未经论证，有待研究的观点）
与自闭症有关的孕产期高危因素*括精神抑郁、吸烟史、病毒感染、高烧、服药史、剖宫产、患儿早产、出生体重低、有产伤、呼吸窘迫综合征及先天畸形等。
早期研究认为自闭症与围产期因素有密切关联，但现在研究者普遍认为，围产期的危险因素并非自闭症的直接原因，它只是有可能加强了已存在的遗传易感性，增加了发病的危险性。
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