中欧航空工程师学院采用精英预科教育和精英工程师教育两个阶段。精英预科教育阶段为三年，与法国路易勒格朗中学合作完成数学和物理教学，并强化法语及英语教学。精英工程师阶段为三年半，教学培养方案由中欧双方及合作企业共同制定，学生通过课堂学习、实验室研究和企业实践等环节完成培养。

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