一、物流企业会计科目设置
物流企业的会计要素也分为资产、负债、所有者权益、收入、费用、利润六大类。根据财政部制定的会计科目，物流企业可以根据自身行业核算的特点，在不影响会计核算要求和财务报告汇总以及对外提供统一的财务报告格式的前提下，自行增设、较少或合并某些会计科目。明细科目一般由企业根据核算与管理的需要自行确定。
二、运输环节的核算
运输是物流企业的主体，在现行物流企业中占有主体地位。
（一）运输业务生产经营的特点
1．运输业务的基本功能是实现货物的位移；
2．运输业务的生产经营活动不产生新的实物形态的产品；
3．运输产品的生产过程和消费过程同时进行；
4．运输产品位移的计量具有特殊性。
（二）运输方式主要*括：公路运输、水路船舶运输、铁路运输、航空飞机运输和管道运输。
（三）物流企业的直接人工由工资费用和其他人工费用两部分组成。根据实际发生额计入相应的会计科目和部门。
（四）其他直接费用*括：折旧费、修理费、过路过桥费、车辆保险费以及行车事故费用。
1．折旧：营运车辆采用*量法、其他固定资产采用直线法；
2．修理费：日常维修和保养，直接计入主营业务成本，受益期在一年以上的大修，先计入长期待摊费用账户，然后摊销计入相应的成本科目和部门；
3．车辆保险费：通常按年支付，支付时计入待摊费用账户，按月摊销时，根据车辆所属部门计入主营业务成本、营运间接费用、管理费用。
三、应交增值税税金的计算
（一）购买燃料、轮胎、维修获取的增值税专用发票进项税税率为17%；
（二）开具的运输专用发票的税率为11%。
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